Структура модов:
Мод - ZIP-архив с расширением *.smod. в Архиве содержаться файлы:
-patch.sm - главный файл, в котором содержиться информация о файлах
check: проверка на существование файла, если он не существует то создать
change: путь к файлу с изменениями
-info.txt - любая информация о моде, авторе и т.д...
-файл, на который укзывает change:
file: указывает имя файла, в котором будут происходить изменения
line: указывает параметры строки, которую необходимо изменить (номер, строка). Если перед line не указан file то ничего не получиться!!!

Ну пока вроде и всё. Если такая программа вас заинтересует, то буду развивать её.
Что будет в новой версии:
Поддержка скриптов игры, тоесть моды будут устанавливаться правильно, а не просто заменяя строки, а изменяя нужные параметры. Возможно будет удаление модов и возможность выбирать, какие моды загружать при установке.